if的故事共有三条路线：白夜王国路线、暗夜王国路线、透魔王国路线。
本作分为三条路线，分别是白夜王国路线、暗夜王国路线、透魔王国路线，前五章为共同章节，第六章开始玩家将要选择阵营。
游戏中，无章、第1章～第5章为共通章节。第6章一开始，玩家将立刻面临抉择：
if选择帮助白夜王国，则第6章～第27章、终章是白夜王国路线，玩家将率领白夜王国击败暗夜王国。
if选择帮助暗夜王国，则第6章～第27章、终章是暗夜王国路线，玩家将率领暗夜王国征服白夜王国。
if选择两边都不帮助，则第6章～第27章、终章是透魔王国路线，玩家将联合白夜、暗夜两国，窥探那深不见底的不可见的真实。
1，游戏难度：
白夜 < 透魔 < 暗夜
白夜王国线，关卡难度相对略低，关键是采用类似觉醒的刷刷乐模式，可在大地图上反复打杂兵赚钱、练级，打造一支无敌战队。非常适合火纹的新玩家。
暗夜王国线，关卡难度较高，采用传统火纹的通关模式，经验值和资金极为有限，玩家必须合理分配，重点培养若干队员，才能通关。很多火纹老鸟已表示卡在某章无力过关，并将暗夜线和火纹历史上难度最高的多拉基亚776相提并论。适合火纹资深玩家（玩过776、晓之女神最高难度、NDS上最高难度的为宜）并对自己智商有自信的玩家。（不过，普通玩家也不是肯定不能玩暗夜王国，游戏有3种难度和3种模式，选最低难度+涅槃模式总是能通关的。即使是面对高级难度，官方还提供了若干刷经验值和资金的DLC，if多花几百日元就可以帮助队伍提升战力）
透魔王国线，关卡难度和暗夜线不遑多让，但是放开了刷刷乐模式，玩家即使第一次打不过去，也可以在多多练级后再次挑战。所以整体难度介于前两条路线之间。
2，可加入的同伴：
由于白夜王国和暗夜王国是敌对关系，if选择了白夜线，暗夜王国的众多角色就无法加入队伍了，甚至，作为敌人，他们中的许多人会战死在你的手中,反之亦然。
透魔线则可以将两国的角色都招募至麾下（极个别除外）。
参考【人物加入方法】
3，人生观：
从前5章可以得知主角曲折的身世：你生于白夜王国，却从小在暗夜王国长大。
在第6章抉择时，一边是虽然有点陌生，却有着血缘关系的亲生母亲和兄弟姐妹，一边是虽然没有血缘，却实质上已经亲如骨肉的兄弟姐妹。
你会选择亲情？还是友情？你更在意铸就在血液中永远无法改变的血亲？还是十多年朝夕相处带来的至亲？
4，世界观：
白夜王国是热爱和平的富庶之国，暗夜王国是崇尚霸权、向白夜王国发起侵略的一方。
在这个架空的世界观中，正逢乱世，你愿意帮助白夜王国以和平之名抵御侵略者？还是帮助暗夜王国完成统一大陆的霸业？
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